Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms