Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NrepQ07475 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms