Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms