Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf4Q06507 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms