Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal1Q05A62 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms