Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dcst1Q059Y8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcst1Q059Y8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms