Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms