Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top1Q04750 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top1Q04750 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms