Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms