Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CkbQ04447 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CkbQ04447 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms