Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl7Q03366 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms