Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms