Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl1Q02067 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms