Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Uba1Q02053 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uba1Q02053 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uba1Q02053 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms