Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp1Q02013 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp1Q02013 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms