Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms