Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms