Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EgfrQ01279 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms