Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gjb2Q00977 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms