Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf7Q00417 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms