Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms