Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms