Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms