Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms