Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prop1P97458 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prop1P97458 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prop1P97458 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms