Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SlbpP97440 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlbpP97440 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlbpP97440 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms