Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms