Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21bP86792 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl21bP86792 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms