Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx3P81067 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Irx3P81067 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms