Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptprn2P80560 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ptprn2P80560 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ptprn2P80560 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ptprn2P80560 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptprn2P80560 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms