Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctps1P70698 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctps1P70698 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms