Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9xP70398 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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