Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms