Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcm1P70348 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms