Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stra8P70278 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stra8P70278 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms