Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms