Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps17P63276 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps17P63276 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms