Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actg1P63260 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms