Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnab1P63143 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnab1P63143 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnab1P63143 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms