Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfybP63139 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfybP63139 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfybP63139 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms