Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms