Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cplx1P63040 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cplx1P63040 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cplx1P63040 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cplx1P63040 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cplx1P63040 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cplx1P63040 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms