Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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