Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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