Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl31P62900 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms