Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ElobP62869 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ElobP62869 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ElobP62869 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ElobP62869 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ElobP62869 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ElobP62869 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ElobP62869 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ElobP62869 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ElobP62869 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ElobP62869 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ElobP62869 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms