Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms