Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f4P62515 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms