Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf6P62331 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf6P62331 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms