Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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